Forurensningsforskriften § 16-1 stiller ikke krav om at vann- og avløpsgebyrene skal «dekke alle» kostnadene som faller inn under selvkost.
Kommunestyret kan derfor vedta at gebyrene kun skal dekke en andel av kostnadene, se selvkostforskriftens §8. Kommunestyret bestemmer selv hvor stor denne andelen skal være. Et slikt vedtak fattes ved behandling av kommende års budsjett og gebyrregulativ.
Når kommunestyret har vedtatt at gebyrgrunnlaget kun skal dekke en andel av selvkost, skal et over- eller underskudd på selvkost beregnes ut ifra denne andelen. Beregningen er vist her på VA-finansiering.no
(Tømming av slam er et eget selvkostområde, med et eget regelverk for avregning av selvkost. Det kommer frem av forurensningsloven § 34, jf. § 26 at kostnadene knyttet til tømming av slam fullt ut skal dekkes til selvkost. Kommunen har altså ikke anledning til å dekke deler av disse kostnadene over kommunebudsjettet på samme måte som den har med vann- og avløpsgebyrene).